Сибирский Хаски - Хаски Форум

щенки хаски

ездовой спорт

выставки

23 Ноября 2017, 06:23:17 *
Добро пожаловать, Гость. Пожалуйста, войдите или зарегистрируйтесь.

Войти
 
   Начало   Помощь Поиск Календарь Войти Регистрация  
Страниц: [1]   Вниз
  Печать  
Автор Тема: Метод контроля происхождения собак по генетическим маркерам  (Прочитано 2970 раз)
0 Пользователей и 1 Гость смотрят эту тему.
PhD
Ветеран
*****
Сообщений: 2889


Окружи меня заботой, когда я состарюсь.


« : 23 Мая 2014, 18:38:03 »

                  МЕТОД КОНТРОЛЯ ПРОИСХОЖДЕНИЯ СОБАК ПО ГЕНЕТИЧЕСКИМ МАРКЕРАМ

Существуют две различные панели генетических маркеров, рекомендованные для установления происхождения собак по их ДНК:

•   рекомендации ISAG - International Society for Animal Genetics: AHTk211, CXX279, REN169O18, INU055, REN54P11, INRA21, AHT137, REN169D01, AHTh260, AHTk253, INU005, INU030, Amelogenin, FH2848, AHT121, FH2054, REN162C04, AHTh171, REN247M23

•   рекомендации AKC - American Kennel Club: PEZ01, PEZ03, PEZ05, PEZ06, PEZ08, PEZ12, PEZ20, UCB2010, UCB2054, UCB2079, PEZ16, PEZ17, PEZ21, GEN.

К сожалению, ДНК-профили собак, тестированные по одной какой-либо версии (ISAG или же  AKC), нельзя сравнивать между собой, например, для уточнения их отцовства (материнства) у полученного помета или же индивидуальных профилей собак.

Международное общество генетики животных (International Society for Animal Genetics - ISAG) группа Applied Genetics of Companion Animals Workshop рекомендует следующие маркеры по локусам микросателлитов ДНК для генетического тестированию собак при контроле их происхождения:




               Как обстоят дела в других лабораториях мира?

•   VETERINARY GENETICS LABORATORY UNIVERSITY OF CALIFORNIA-DAVIS SCHOOL OF VETERINARY MEDICINE – по 24 локусам (ISAG), http://www.vgl.ucdavis.edu/services/CatandDogDNATyping.php , США
•   ANTAGENE – по 21 маркеру + 1 маркер гендерный (ISAG 2006), http://www.antagene.com/en/solutions/antagene-parentage-dog , Франция
•   GENINDEXE – по 23 локусам (ISAG 2006), http://www.genindexe.com/uk/ , Франция
•   Genomia – 17-22 маркера (ISAG 2006), http://www.genomia.cz/en/ , Чехия
•   AnimalGenetics – по 19 локусам (ISAG 2006), http://www.horsetesting.com/Canine/CanineProfile.htm , Финляндия
•   Finnzymes Diagnostics – по 19 локусам (ISAG 2006), http://diagnostics.finnzymes.fi/canine_parentage_testing_and_identification.html  , Финляндия
•   PROGENUS – по 19 локусам (ISAG 2006), http://www.progenus.be/ , Бельгия
•   MMI Genomics – по 13 локусам + 1 гендерный маркер (пол) (согласно AKC - American Kennel Club), http://www.metamorphixinc.com/ , США
•   Genoscoper Laboratories  – профили  ISAG или AKC http://www.genoscoper.com/en/products/tests-dog  , Финляндия
•   GENOS – по 10 локусам (согласно AKC, тест-система Аpplied Biosystems), http://genos.hr/en/services/tests-animal-dna/dogs-dna-test/ , Хорватия
•   HealthGene Corporation - по 10 локусам (ISAG ?), http://www.healthgene.com/ , Канада
•   ЗООГЕН – по 14 локусам (10 маркеров из AKC:  PEZ05, PEZ11, PEZ19, FH(UCB)2010, FH(UCB)2079, PEZ01, FH(UCB)2054, PEZ07, PEZ08, PEZ12, PEZ03, PEZ06, PEZ16, PEZ18


        Тест-системы коммерческие для генетического тестированию собак для определения их происхождения

•   Finnzymes Diagnostics: Canine Genotypes™ Panel 1.1 Kit -  по 19 маркерам согласно рекомендации ISAG 2006, http://diagnostics.fnnzymes.fi
•   Thermo Scientifc: Canine Genotypes Panel 1.1 - по 19 маркерам согласно рекомендации ISAG 2006, http://thermoscientific.com/onebio
•   Аpplied Biosystems: StockMarks for Dogs Genotyping Kit Canine – по 10 локусам (панель версии American Kennel Club) http://www.appliedbiosystems.com/
•   MMIG’s SuperPlex plus Gender Marker (SuperPlex-G) panel of DNA markers – по 13 локусам +  1 локус гендерный,  American Kennel Club
Записан

"Бог создал орехи, но он не будет колоть их для нас". И.В. Гете.

"Три пути ведут к знанию: путь размышления - это путь самый благородный, путь подражания - это путь самый легкий и путь опыта - это путь самый горький." Конфуций.
PhD
Ветеран
*****
Сообщений: 2889


Окружи меня заботой, когда я состарюсь.


« Ответ #1 : 23 Мая 2014, 18:39:38 »

Инбридинг  у чистопородных собак – довольно частое явление. К тому же, у разных пород собак коэффициент инбридинга имеет неодинаковые величины, как и частота встречаемости тех или иных аллелей в породе (популяции).

Поэтому, уважающие себя лаборатории, занимающиеся тестированием генетических образцов животных, имеют ОДНО ПРАВИЛО:  для генетического тестирования собак при определении их происхождения ВСЕГДА требовать образцы от ОТЦА и от МАТЕРИ тестируемых ПОТОМКОВ(а).  Чтобы не было разногласия в чтении данных, полученных методом генотипирования ДНК-профилей животных. Таковы правила регистрации и сертификации пометов в АКС.

Анализ большого количества локусов достоверно устанавливает вероятность отцовства (материнства).
 
Для дуэта ребенок - предполагаемый отец в случае отсутствия другого родителя, уровень доказательности экспертного заключения вероятности отцовства должен быть не ниже 95%. При анализе отец, мать и потомок – вероятности отцовства (материнства) составляет 99%.

Однако эта точность уменьшается, когда потенциальные родители являются животными, находящимися в родстве (инбредные особи): такие животные являются обладателями маркерных аллелей, схожими с родительскими аллелями и аллелями потомства, полученного от родственных им собак – т.е. налицо некоторая генетическая сходность.

Поэтому, для предотвращения ошибочного установления происхождения (родства), заводчики должны представить образцы всех возможных родителей (в случае, когда предполагается или известно о двойной вязке): матери, отца (или  отцов), потомка(ов).

В случае установления у одного щенка возможности отцовства 2 кобелей или получении неоднозначности результатов, необходимо провести генотипирование с дополнительными генетическими маркерами для уточнения фактического отцовства.
Записан

"Бог создал орехи, но он не будет колоть их для нас". И.В. Гете.

"Три пути ведут к знанию: путь размышления - это путь самый благородный, путь подражания - это путь самый легкий и путь опыта - это путь самый горький." Конфуций.
PhD
Ветеран
*****
Сообщений: 2889


Окружи меня заботой, когда я состарюсь.


« Ответ #2 : 23 Мая 2014, 23:35:03 »

Примеры результатов тестирования:

1 картинка: мать - отец - щенок

2 и 3 картинки: мать - отец - щенок 2 и щенок 1



* AG1.jpg (129.19 Кб, 884x649 - просмотрено 29 раз.)

* 124616 ISAG 1.jpg (142.36 Кб, 899x651 - просмотрено 6 раз.)

* 234038 ISAG2.jpg (143.87 Кб, 903x647 - просмотрено 3 раз.)
« Последнее редактирование: 23 Мая 2014, 23:43:47 от PhD » Записан

"Бог создал орехи, но он не будет колоть их для нас". И.В. Гете.

"Три пути ведут к знанию: путь размышления - это путь самый благородный, путь подражания - это путь самый легкий и путь опыта - это путь самый горький." Конфуций.
PhD
Ветеран
*****
Сообщений: 2889


Окружи меня заботой, когда я состарюсь.


« Ответ #3 : 24 Мая 2014, 01:05:42 »

В США и некоторых европейских странах (например, в Скандинавии) разрешена так называемая двойная вязка - когда суку вяжут двумя разными кобелями. Когда рождаются щенки, вы заказываете ДНК тесты на помет -  это дешевле, нежели на одну особь, и отправляете обратно. Вам присылают результаты кто чей отец. На основании этого ДНК-теста будут выдаваться родословные на щенков.

Основное требование - профиль ДНК суки и кобелей должен быть в базе данных ДНК. Каждый щенок предварительно должен быть чипирован.

Примеры результатов тестирования такого помёта:

ДАНО:
ПЛАНОВАЯ двойная вязка суки MABEL двумя кобелями BAREK/BRUNO (2012); Breed: SSD (Шилонская овчарка - Шилон) .

ИТОГ:
рождение помёта из 9 щенков.

Мать: MIRACLE'S MA BELLE ACADIENNE, Color: Gold Sable Plush



Предполагаемый отец №1: Noble's Barek of Robson, Color: Solid Black Dual Plush



Предполагаемый отец №2: Xanadu's Locked & Loaded, Color: Gold Sable Plush



Щенки: BLACK CHERRY, CHOCOLATE, MINT CHOCOLATE CHIP, PISTACHIO, COOKIES & CREAM, PEACH, PINEAPPLE, TANGERINE, TUTTI FRUTTI.

Результаты генетического тестирования всего помёта из 9 щенков выявили, что:

                                                Noble Barek of Robson Arms является отцом 8 щенков,
                                                Xanadu's Locked & Loaded - отец 1 щенка (PISTACHIO).
« Последнее редактирование: 24 Мая 2014, 01:25:14 от PhD » Записан

"Бог создал орехи, но он не будет колоть их для нас". И.В. Гете.

"Три пути ведут к знанию: путь размышления - это путь самый благородный, путь подражания - это путь самый легкий и путь опыта - это путь самый горький." Конфуций.
PhD
Ветеран
*****
Сообщений: 2889


Окружи меня заботой, когда я состарюсь.


« Ответ #4 : 24 Мая 2014, 01:40:22 »

          ДНК-профили 9 щенков-шилонов, полученных от плановой двойной вязки суки MIRACLE'S MA BELLE ACADIENNE (NCD11543)

отец Noble Barek of Robson Arms , NCD11542

1. BLACK CHERRY, NCD11544:


2. CHOCOLATE, NCD11545


3. MINT CHOCOLATE CHIP, NCD11546


4. COOKIES & CREAM, NCD11548


5. PEACH, NCD11549


6. PINEAPPLE, NCD11550


7. TANGERINE, NCD11551


8. TUTTI FRUTTI, NCD11552


отец Xanadu's Locked & Loaded, TSS221

9. PISTACHIO, NCD11547

Записан

"Бог создал орехи, но он не будет колоть их для нас". И.В. Гете.

"Три пути ведут к знанию: путь размышления - это путь самый благородный, путь подражания - это путь самый легкий и путь опыта - это путь самый горький." Конфуций.
PhD
Ветеран
*****
Сообщений: 2889


Окружи меня заботой, когда я состарюсь.


« Ответ #5 : 24 Мая 2014, 02:06:25 »

Сертификаты с профилями AKC - American Kennel Club:





Записан

"Бог создал орехи, но он не будет колоть их для нас". И.В. Гете.

"Три пути ведут к знанию: путь размышления - это путь самый благородный, путь подражания - это путь самый легкий и путь опыта - это путь самый горький." Конфуций.
Катечка
Ветеран
*****
Сообщений: 3320


Хатиро, Роксиро, Ягами, Нюша и Насося...


WWW
« Ответ #6 : 24 Мая 2014, 04:13:57 »

вот вроде очень интересно, а не понятно... по крайней мере мне... прости
Записан

tino
Старожил
****
Сообщений: 275



« Ответ #7 : 20 Июня 2014, 19:54:30 »

возможно ли имея профиль ДНК определить наличие примесей других пород в собаке?
Записан
Stormbringer
Модератор
*****
Сообщений: 5777


u run like the river, u shine like the sun


« Ответ #8 : 14 Марта 2016, 20:41:40 »

у меня вопрос не по конкретному тесту, а по самой технологии отбора проб. Как вообще этой щеточкой тереть-то надо в пасти, чтобы достаточно материала попало куда надо? Пишут, на одну собаку надо предоставить 4 разные щеточки.. ну это ладно еще. А вот как конкретно правильно отбирать не совсем понятно.
Записан
PhD
Ветеран
*****
Сообщений: 2889


Окружи меня заботой, когда я состарюсь.


« Ответ #9 : 14 Марта 2016, 21:03:59 »

http://www.mydogdna.com/ru/kak-eto-rabotaet


1.  На прилагаемый прямоугольный конверт разборчиво напишите однозначную идентификацию обследуемого животного
  (номер образца (если был выделен), кличку животного  и т.д.).

2.  Ротовая  полость животного  перед  отбором  образцов  должна  быть  чистой. Желательно,  чтобы  за  15 мин.  до  отбора
  образцов животное не ело и не пило.

3.  Извлечь  стерильную щеточку из упаковки. Не дотрагивайтесь щетинок щеточки! Следите, чтобы щетинки щеточки не
  коснулись иной поверхности, кроме ротовой полости обследуемого животного.

4.  Щеточку разместите между щекой и челюстью животного и проведите отбор мазка  (10 вращательно-поступательных
  движений).  Постарайтесь,  чтобы  щеточка  со  всех  стран  коснулась  слизистой  оболочки  внутренней  стороны  щеки
  животного. Не берите мазки с языка, не собирайте слюну. Мазок должен содержать видимое количество клеток.

5.  Щеточка должна просохнуть на воздухе, необходимо держать щеточку на весу. На влажной щеточке по пути в лаборатории
  может начаться процесс гниения.

6.  Сухую щеточку положить в подписанный прямоугольный конверт.

7.  Повторить порядок действий, описанный в п. 3-6, со второй щеточкой. Обе щеточки положите в один конверт и заклейте
 конверт.

Это рекомендации "Геномии".
 
Записан

"Бог создал орехи, но он не будет колоть их для нас". И.В. Гете.

"Три пути ведут к знанию: путь размышления - это путь самый благородный, путь подражания - это путь самый легкий и путь опыта - это путь самый горький." Конфуций.
Kuzya
Ветеран
*****
Сообщений: 10435


Мне абсолютно все равно что вы обо мне думаете.


WWW
« Ответ #10 : 14 Марта 2016, 21:13:53 »

Валер

https://www.youtube.com/watch?v=n1YSCd1xEAc

https://www.youtube.com/watch?v=3TDroNgDUl0
Записан

Stormbringer
Модератор
*****
Сообщений: 5777


u run like the river, u shine like the sun


« Ответ #11 : 14 Марта 2016, 21:50:23 »

Спасибо огромное! и понятно, и наглядно да-да

Цитировать
Извлечь  стерильную щеточку из упаковки
вот, кстати, VGL ничего не пишут о стерильности щеточек. Якобы, можно купить любые interdental brushes, главное, не слишком узкие. У нас такое в магазинах не продают, но есть подходящего размера на ebay. Они с колпачками, но, естественно, не стерильные. Плохо?
« Последнее редактирование: 15 Марта 2016, 07:03:06 от Stormbringer » Записан
Unpener
Ветеран
*****
Сообщений: 1866



« Ответ #12 : 14 Марта 2016, 22:12:04 »

 А мне из Шведского Королевского Университета пересылались палочки в комплекте с бумажками тип промокашки  в конвертиках. Палочки промакивались на бумагу и отправлялась на тест только она
Записан
Stormbringer
Модератор
*****
Сообщений: 5777


u run like the river, u shine like the sun


« Ответ #13 : 14 Марта 2016, 22:17:07 »

Цитировать
 А мне из Шведского Королевского Университета
а там AHE тестируют?


Цитировать
и как я раньше-то туда не заходила! И ведь совсем рядом!  круто
Записан
Unpener
Ветеран
*****
Сообщений: 1866



« Ответ #14 : 15 Марта 2016, 07:15:33 »

 Не знаю Я сдала тесты для работ по происхождению собаки Петера Саволайнена. В начале двухтысячных для России это был единственный шанс услышать что то про генетику моих исходных производителей, привезенных с Чукотки. На тесты шли только кобели и пришлось исхитриться, введя потомков, на которых, на которых можно было посмотреть и сучью сторону. Правда пока нам отписано только "все представленные генетические материалы уникальны, несомненно представляют собой отдельные породы, далекие от образованных, и еще дальше от волка чем они". Все остальное Саволайнен жмет до публикации. Вот такими терниями были генетические тесты в России в начале двухтысячных.
« Последнее редактирование: 15 Марта 2016, 09:02:30 от Unpener » Записан
Страниц: [1]   Вверх
  Печать  
 
Перейти в:  


  Rambler's Top100  Яндекс цитирования     
Страница сгенерирована за 0.07 секунд. Запросов: 22. Powered by SMF 1.1.2 | SMF © 2006, Simple Machines LLC